Joensuun yliopisto aloitti toimintansa vuonna 1969 (Joensuun korkeakoulu vuoteen 1984). 

Joensuun ja Kuopion yliopistot yhdistyivät Itä-Suomen yliopistoksi vuoden 2010 alussa. 

Itä-Suomen yliopisto on yksi Suomen suurimmista tiedeyliopistoista. Uudessa yliopistossa on noin 15 000 opiskelijaa ja siellä työskentelee noin 2 800 henkilöä. 

Yliopistolla on kampukset Joensuussa, Kuopiossa ja Savonlinnassa. 

Monialainen yliopisto tarjoaa opetusta yli 100 pääaineessa. Tiedekuntia on neljä: filosofinen tiedekunta, luonnontieteiden ja metsätieteiden tiedekunta, terveystieteiden tiedekunta sekä yhteiskuntatieteiden ja kauppatieteiden tiedekunta. 

Yliopiston toiminnassa korostuu monitieteisyys. Yhdistymisen myötä toisiaan täydentävien tieteenalojen rajapinnoille syntyy uusia tutkimusalueita.